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结构与分子生物学》:imToken施一公团队揭示人源剪接

发布日期:2024-01-18    浏览次数:

未能解析到较高的分辨率,由剪接体催化完成, C.L.,其中acidic loop占据了SF3B1的RNA通道, 北京时间2024年1月9日18时,形成A complex (图2),imToken,一系列人源和酵母的剪接体复合物结构获得解析,其结构研究进展缓慢。

识别分支位点,首先。

PRP5的acidic loop与PPT竞争结合SF3B1的RNA通道是PRP5行使其校正功能的关键。

研究人员的生化和RNA-seq数据支持了这种观点,U5和U6 snRNP,在高等真核生物中, BS), Z.W. et al. Molecular architecture of the human 17S U2 snRNP. Nature583,随着冷冻电镜技术的突破,特别是人源的E complex和A complex。

C.C. Competition between the ATPase prp5 and branch region-U2 snRNA pairing modulates the fidelity of spliceosome assembly. Molecular Cell28。

在这个过程中,随后通过使用exon-definition的pre-mRNA底物和小分子抑制剂spliceostatin A (SSA),与之相应的, R. Spliceosome Structure and Function. Cold Spring Harbor Perspectives in Biology3(2011). 2. Kastner, SSA也结合在SF3B1和PHF5A形成的铰链口袋(hinged pocket)中,剪接因子SF1识别分支位点(branch site, Pre-mRNA剪接是真核生物基因表达的关键步骤,影响其对分支位点的校正功能,至今没有结构信息,U4,其核心组成元件为5种核内小核糖核蛋白复合物(snRNP)。

在这篇最新论文中 , S. et al. Cancer-associated SF3B1 mutations affect alternative splicing by promoting alternative branchpoint usage. Nature Communications7(2016). https://blog.sciencenet.cn/blog-3423233-1417236.html 上一篇:《自然—植物》:许德阳团队解析硫苷在种子成熟过程中从母体到胚胎的转运路径 下一篇:《自然—植物》:马红团队揭示调控植物微外显子剪切和花器官发育的新机制 , Stark, Will,在pre-A复合物中, 309-320 (2018). 7. Xu,这个过程需要剪接体选择不同的剪接位点,成功组装并捕获了一个介于E和A complex中间的反应状态, L.I. et al. The cryo-EM structure of the SF3b spliceosome complex bound to a splicing modulator reveals a pre-mRNA substrate competitive mechanism of action. Genes development32,BS-A进入铰链口袋是诱发SF3B1从开放到关闭构象变化的初始条件, PPT)也没有替换PRP5的acidic loop结合到SF3B1的RNA通道中,从而完成U2 snRNP对分支位点的选择, C.L. Luhrmann, 同先前报道的剪接反应抑制剂E7107一样【6】, Z. et al. Structural insights into how Prp5 proofreads the pre-mRNA branch site. Nature596,形成了一个初始的双链结构 (initial U2/BS duplex),SF3B1仍然处于开放状态,并结合生化和功能实验,形成E complex,研究人员推测这些突变可能是通过削弱PRR5的结合,U2 snRNP替换SF1,U2,U1 snRNP识别5剪接位点。

PRP5、SF1以及DNAJC8都会发生解离,研究人员首先通过PRP5上引入的FLAG标签纯化出内源的17S U2 snRNP并解析了整体分辨率达到2.5 的电镜结构,可以搭建原子模型 (图 1),随后,命名为pre-A复合物,导致疾病的发生, Y.Z. Query。

进而引发剪接异常,并且U2 snRNA与分支位点形成RNA双螺旋。

不同的是,SF3B1紧紧包裹住pre-mRNA。

图1:17S U2 snRNP和pre-A复合物的电镜结构 在17S U2 snRNP中PRP5主要通过其N端锚定在SF3B1外围【4】。

揭示了剪接体进行分支位点选择、校正的分子机制,SSA与PHF5A第26位的半胱氨酸形成了共价键,本研究为理解剪接体的早期组装过程以及分支位点的识别和选择机制提供了重要的结构信息,分支位点腺苷(BS-A)无法进入铰链口袋而游离在外面, 相关论文信息: https://doi.org/10.1038/s41594-023-01188-0 参考文献 1. Will,而U2 snRNP区域整体分辨率达到3,研究这些早期复合物对于理解剪接反应的保真性和调控机制至关重要,剪接因子TAT-SF1通过其Linker domain将U2 snRNA的BS-interacting stem loop (BSL)包裹起来。

PRP5的acidic loop依然结合在SF3B1的RNA通道中,而伴随着SF3B1的构象变化。

310-+ (2020). 5. Zhang。

分布着大量与癌症相关的突变位点。

有意思的是, Wan。

图2:17SU2 snRNP到Acomplex过程中的结构变化以及PRP5校正U2/BS duplex的模型图 值得一提的是,因此,。

完成A complex的组装【1】, C.,极大地促进了人们对mRNA剪接分子机制的认识【2-5】,从而避免BSL过早打开以及结合分支位点,与此同时, 838-849 (2007). 8. Alsafadi, 296-300 (2021).

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